柑桔病害常见的达50种，主要有以下几种：
1.黄龙病（类细菌，BLO）
又称黄梢病，热区几乎都有，而且目前浙江温州、湖南宜章、四川西昌也有分布，是一种由木虱传播的，具毁灭性的传染性病害。防治：①新区要严格检疫，禁止从病区传入苗木或接穗；②老区在培育无病苗的基础上改造旧果园，包括挖除病树、加强肥水管理、及时防治木虱。
2.溃疡病
（Xanthomonas campestris pv.citri）
是普遍发生的细菌病害，危害枝梢、叶片、果实，影响树势和果实品质，严重时引起落叶、落果和枝梢干枯。防治：①严格苗木检疫，培育无病苗木；②冬季彻底剪除有病枝叶，集中烧毁，消灭越冬病源；③幼龄树通过抹芽控梢，使夏秋梢抽吐整齐，以利喷药保梢；青壮年结果树，通过控制夏梢，减少病害发生；④喷药保梢护果，重点在新梢长2～3cm时喷一次药，到自剪再喷一次护梢；幼果应在盛花后10d开始喷药，可用铜皂液或0.5%波尔多液、氧氯化铜600～700倍液及600～1000mg/L的链霉素（加1%酒精）等；⑤种植防风林，减轻台风的为害。
3.裙腐病
（Phytophthora nicotianae var.parasitica为主）
又名褐腐病，主要危害根颈部和根群，导致树势衰退，以至死亡。防治：①选用抗病砧木（枳砧等）；②定植不能过深，覆土不超过根颈，中耕不要伤及树皮，雨后及时排除积水，不施未腐熟的肥料；③及时用刀刮除病部，并用1∶50的58%瑞毒霉锰锌或80%乙磷铝涂抹伤口。
4.柑桔立枯病
（Rhizoctonia solai，Phomopsis cytosporella，Phytophthora spp.）
病菌侵害幼茎和根颈，造成幼苗枯死。防治：①选排灌方便，通透性较好的砂壤土作苗圃，避免连作；②做好土壤消毒，播前喷100～150倍二硝散或50%代森胺500倍液；③加强苗圃土壤管理，幼苗出土后立即撒黑白灰（草木灰∶石灰=2∶1），雨后及时排除积水；④及时拔除病株并集中烧毁，发病部位撒施石灰，并全面喷1～2次70%百菌清600倍液或0.5%波尔多液，以控制蔓延。
5.根结线虫病
（Meloidogyne spp.）
被害植株小根的表面有明显瘤状物。严重时可使叶片黄化、脱落，甚至小枝枯死，结果量减少。防治：①严格检疫，发现病株立即烧毁；②培育无病苗木，病苗用40～70℃温汤浸根10min，杀死线虫，选无线虫地段建园；③在线虫发生的果园，拨开受害株的根附近的表土，每株用克线丹颗粒剂15～20g撒施，然后覆土并灌水消灭根线虫。
6.裂果病
生理病害，多由水分不平衡引起，改良橙（红江橙）等果皮薄的类型发生较严重。被害果实极易遭地霉（Geotrichum candidum）侵染，发展为酸腐病。防治：①谢花后至7月放梢前喷GA330～50mg/L+2，4-D 15～20mg/L两次，秋季喷0.5%Ca（NO3）2以及“沃生”叶面肥，增强果皮的抗力，减少裂果；②秋旱期间用死物覆盖保持土壤适当湿润，避免土壤骤干骤湿；③适当增施钾肥和钙肥。
