三域系统是由卡尔·乌斯(Carl Woese)在1977年提出的细胞生命形式分类，将原核生物分成了两大类，起初称为真细菌（Eubacteria）和古细菌（Archaebacteria）。Woese依据16S rRNA序列上的差别，认为这两类生物和真核生物一起从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别演化而来，因此将三者各置为一个“域”（Domain），作为比“界”高一级的分类系统，并分别命名为细菌域（Bacteria）、古菌域（Archaea）和真核域（Eukarya）。
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